民間非營利組織設立會計科目的問題上，應執(zhí)行《民間非營利組織會計制度》， 有點近似事業(yè)單位會計制度,，科目分類是資產(chǎn)、負債,、凈資產(chǎn)、收入,、支出,，會計科目也與企業(yè)會計準則略有區(qū)別（民非組織會計制度可以網(wǎng)上下載）。財務處理上,，重點有（與企業(yè)會計區(qū)別較大的地方）：
　　1）沒有實收資本,，收到的投資或捐助款，直接計入對應的收入科目,，主要有,，捐贈收入、會費收入,、政府補助收入,、提供服務收入、商品銷售收入,、投資收益,、其他收入等。
　　2）支出沒有那么細的分類,，與業(yè)務相關的都計入“業(yè)務活動成本”,；與管理相關的都計入“管理費用”（可設置明細科目）；“財務費用”科目在民非機構(gòu)中稱為“籌資費用”,；不好判斷的支出都計入“其他費用”,。
　　3）期末結(jié)轉(zhuǎn)凈資產(chǎn)。凈資產(chǎn)分為“非限定性凈資產(chǎn)”和“限定性凈資產(chǎn)”,，收到的貨幣如果指定用途的即為“限定性”,，其他都是“非限定性”。結(jié)轉(zhuǎn)分錄
　　借：非限定性凈資產(chǎn)
　　貸：業(yè)務活動成本 / 管理費用 等
　　借：捐贈收入 / 會費收入 / 提供服務收入 等
　　貸：非限定性凈資產(chǎn)
　　其他科目,，與企業(yè)會計準則的記賬原則和使用都一樣,。
　　報表也是用民間非營利組織會計報表，有資產(chǎn)負債表,、業(yè)務活動表,、現(xiàn)金流量表。
　　民間非營利組織如果交稅,，是營業(yè)稅,。除了經(jīng)營性收入（服務收入和銷售產(chǎn)品收入）外，捐贈,、會費,、政府補助等收入都是免稅的,。到稅務機關（地稅）申請免稅項目。會費收據(jù)到財政申領,。