自2008年6月1日起,，納稅人生產(chǎn)銷售或批發(fā),、零售有機肥料、有機—無機復混肥料和生物有機肥免征增值稅,。有機肥料是指來源于植物和（或）動物,，施于土壤以提供植物營養(yǎng)為主要功能的含碳物料,；有機—無機復混肥料是指由有機和無機肥料混合或化合制成的含有一定量有機肥料的復混肥料；生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體（如禽畜糞便,、農(nóng)作物秸稈等）為來源并經(jīng)無害化處理,、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料,。
納稅人銷售免稅的有機肥產(chǎn)品，應按規(guī)定開具普通發(fā)票,，不得開具增值稅專用發(fā)票,。納稅人申請免征增值稅，應向主管稅務機關提供以下資料,，凡不能提供的,，一律不得免稅。（1）生產(chǎn)有機肥產(chǎn)品的納稅人：a.農(nóng)業(yè)部或省,、自治區(qū),、直轄市農(nóng)業(yè)行政主管部門批準核發(fā)的在有效期內(nèi)的肥料登記證復印件，并出示原件,。b.肥料產(chǎn)品質(zhì)量檢驗機構一年內(nèi)出具的有機肥產(chǎn)品質(zhì)量技術檢測合格報告原件,。出具報告的肥料產(chǎn)品質(zhì)量檢驗機構須通過相關資質(zhì)認定。c.省,、自治區(qū),、直轄市外銷售有機肥產(chǎn)品的，還應提供在銷售使用地省級農(nóng)業(yè)行政主管部門辦理備案的證明原件,。（2）批發(fā),、零售有機肥產(chǎn)品的納稅人：a.產(chǎn)企業(yè)提供的在有效期內(nèi)的肥料登記證復印件。b.產(chǎn)企業(yè)提供的產(chǎn)品質(zhì)量技術檢驗合格報告原件,。 c.省,、自治區(qū)、直轄市外銷售有機肥產(chǎn)品的,，還應提供在銷售使用地省級農(nóng)業(yè)行政主管部門辦理備案的證明復印件,。